这个问题可能与折叠屏设备的特性或微信版本有关。当使用 navigateToMiniProgram 打开另一个小程序时，界面没有完全覆盖可能是由于页面布局、窗口大小、或者某些控件在折叠屏上没有正确适配所致。你可以尝试以下几种解决方案：

1. 更新微信版本：首先确保微信和基础库都更新到最新版本，新的版本可能已经解决了与折叠屏相关的兼容性问题。
2. 检查折叠屏适配：折叠屏的适配性可能需要额外的布局处理。可以通过 wx.getSystemInfoSync() 获取设备信息，判断是否为折叠屏设备，并根据设备的屏幕状态进行适当的页面调整。
3. 尝试其他跳转方式：可以尝试 navigateTo 或 redirectTo 等其他跳转方法，看看是否能解决覆盖不完全的问题。
4. 使用微信小程序提供的适配API：微信提供了一些接口用于适配不同的屏幕和设备，确保使用这些API来提高兼容性。

如果上述方法都不行，建议向微信小程序团队反馈，提供详细的设备信息、操作流程和截图，以便他们进一步调查该问题。